在菌种冻干过程中，微生物悬液首要被快速冷冻至-40℃，使细胞内游离水构成冰晶。随后在线Pa，冰晶直接升华为为水蒸气逸出，终究取得含水量仅3%的枯燥菌粉。有用保持细胞膜结构和蛋白质活性，使微生物处于休眠状况。

  冻干工艺的中心在于操控预冻速率、枯燥温度和真空度三大参数。依据试验，乳酸菌的最适冷冻速率为3-5℃/min，酵母菌则为3-10℃/min。过快的冷冻会导致胞内冰晶损害细胞器，而过慢的冷冻则使细胞外溶质浓度升高引发渗透压休克。冷冻枯燥阶段需将物料温度从始至终保持在共晶点以下。

  SFD冻干设备完成PLC智能化操控，准确调控搁板温度（±1℃）和线Pa）。工业级冻干机选用辐射式加热和硅油循环系统，使10kg菌泥的枯燥周期缩短至24小时。疫苗生产领域，冻干技能成功处理了脊髓灰质炎疫苗在热带地区的耐热性问题；在食物制造业中，冻干益生菌制剂已大范围的使用于酸奶发酵和膳食弥补剂。跟着微胶囊技能发展，选用肠溶包衣的冻干菌粉可完成胃液通过率90%，提高口服益生菌制剂的效果。

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